เรื่องราวในภาคนี้พาเราไปพบกับโครงการลับสุดยอดที่ได้รับการสนับสนุนจากมหาเศรษฐีคนหนึ่ง โดยมีเป้าหมายในการดัดแปลงพันธุกรรมของฉลามหัวบาตรให้มีความฉลาดและดุร้ายมากขึ้น
นักอนุรักษ์ปลาฉลาม อย่าง ดร.มิสตี้ คาลฮูน ได้รับเชิญให้เข้าร่วมโครงการนี้ในฐานะที่ปรึกษา แต่แล้วเธอก็พบว่าการทดลองนี้ได้นำมาซึ่งผลกระทบที่คาดไม่ถึง เมื่อฝูงฉลามที่ถูกดัดแปลงพันธุกรรมต้องการเป็นอิสระและพร้อมจะทำลายทุกสิ่งที่ขวางทาง