สถานการณ์ใหม่บังคับให้ Lilo และเพื่อนมนุษย์ต่างดาวของเธอต้องแยกทางกัน ในขณะที่ Gantu และ Dr. Van Hamsterviel สร้างร่างโคลนของ Stitch ชื่อ Leroy เพื่อจับการทดลองทั้งหมดและยึดครองกาแล็กซี